南京军区守备三师前身是胶东军区组建的南海军分区独立1团，以后沿革为连云港守备区、守备18旅、守备18师、济南军区守备一师，目前延续为连云港警备区，是一支具有光荣革命传统的英雄部队。

1949年4月，胶东军区在即墨组建警备第4旅，又称青岛警备旅，旅部由胶东军区抽调干部组成，下辖警备第10、11、12团和炮兵团，分别由南海军分区第1团、即东独立团、即西独立团改称和由军区炮兵营扩编。警备4旅参加过解放青岛的战役。

1950年10月，警备第4旅改编为军史第二个100师，（原100师改为炮兵63师）归山东军区建制，该部编为100师第298团，

1951年1月，山东军区工兵营调归该团建制。（1955年底，复归山东军区建制领导。）

1953年，山东军区警卫2营调归该团建制。

1955年4月，步兵第298团和山东军区烟台国防工程建筑指挥部青岛第3工区编为连云港要塞区。

1955年5月，济南军区成立，连云港要塞区改归济南军区建制。

1956年1月，编为连云港守备区，执行师级权限。山东军区步兵第299团、警备第10团调归连云港守备区建制领导，扩编为守备第26旅（1959年改为守备26师）；原守备区改编为守备第18旅。

1957年6月，江苏军区边防第12团改编为守备第44团，调归守备第18旅建制。（边防12团前身为新四军3师8旅24团。8旅24团➤苏北军区盐城军分区警备4团➤公安边防军第82团➤公安边防军第12团）

1959年8月，守备第18旅改称守备第18师，辖守备第44团及5个独立营。

守备第18师，6117部队

守备第44团，6118部队：原边防12团，团部驻大伊山。

守备第46团，6119部队：以独立第1、2、3营为基础扩编，团部驻墟沟；

守备第47团，6120部队：独立第5营扩编，团部驻东西连岛。

1961年3月，守备26师43团4营4个连队调入编为守备18师步兵营。

1962年8月，守备第44团2营和3营大部划归江苏省军区守备第76团，由68军203师调来3个连队充实守备第44团，重组第2、3营。

1966年，守备18师直属海上运输队扩编为团级船运大队。

1970年1月，改称济南军区守备一师，9618部队（后改为54608部队）

守备第44团改称守备1团，9619部队（后改为54610部队）

46团改称2团，9620部队（后改为54612部队）

47团改称3团，9621部队（后改为54614部队）

1976年11月，济南军区守备二师守备第4团，调归守备一师建制领导，代号54618部队。

1977年3月，守备一师进行整编：

师直组建1个炮兵营、1个通信营；

船运大队改为营级船运队。

整编后，守备一师辖4个守备团、4个直属营和6个直属连。

1978年10月1日，济南军区守备一师转隶南京军区建制，归江苏省军区领导，番号改称南京军区守备三师，54608部队。

守备第1团改为守备第30团，54609部队

2团➤31团，54610部队

3团➤32团，54611部队

守备第4团转隶济南军区青岛警备区建制。

1981年1月，江苏省军区独立师撤消，原独立师炮兵团和高炮营调归守备三师建制领导，改称守备三师炮兵团和高炮营。

1982年11月，守备三师直属步兵营撤消，直属130加农炮连划归守备第31团2营建制。

1985年9月5日，与江苏省军区连云港军分区合编为连云港军分区，代号为83075部队；

守备第30团和32团合编为新的守备第30团，83076部队（移防至赣榆青口）；

守备第31团和炮兵团番号不变，代号分别为83077部队、83078部队。

1990年11月17日，连云港军分区改称江苏省军区连云港警备区，73200部队；

守备第30团改称南京军区守备第1团，73201部队；

守备第31团改称南京军区守备第2团，73202部队；

炮兵团不变，代号为73203部队。

1993年1月，南京军区守备第2团编为南京军区海防第2团。

2017年4月，南京军区海防第2团编入东部战区陆军海防第3XX旅。