目前，在机构改革中，涉及自然资源部门的主要有三个新情况：一是大部分地方市县两级自然资源执法队伍正在被陆续撤销；二是个别地方把城市综合行政执法局撤销了，自然资源执法职责重回自然资源部门，比如北海市；三是有的地方把自然资源部门与城乡建设部门合并了，比如武汉市。

而此前一些地方将部分执法权下放乡镇后，由于不同程度出现“接不住、管不好”和“小马拉大车”问题，又在陆续收回下放的部分执法权，比如广东。

广西北海市自2024年6月10日起，撤销市政府下设的城市综合执法局，工作人员停止使用市综合行政执法局的工作证，并将其原有的行政执法职责重新划分回各个相关主管部门。这包括住房和城乡建设、自然资源、交通运输、生态环境、工业和信息化、旅游文体广电、商务、人力资源和社会保障等领域的行政执法职责。

根据北海市最新出台的机构改革方案，将市综合执法局的自然资源、住房与城乡建设等领域的行政执法职责划归相关主管部门承担。

这一变化意味着北海市将回归传统的分散执法模式，不再保留市综合行政执法局，城市综合执法局正式退出历史舞台。

而在其他地方，由于自然资源执法未列入七大综合行政执法队伍（市场监管、生态环境、文化市场、交通运输、农业综合、应急管理、城市管理），市、县两级自然资源执法队伍正在被陆续撤销。

主要有三种模式：一是人员进机关，原执法队伍属于参公编制的，人员整体进入机关，职责由局内设执法科（处）承担；二是原执法队伍人员保留但更名，不再行使执法权，主要是为执法工作提供技术支撑和服务保障工作；三是原执法队伍撤销后，人员分流到市辖分局，或县级综合执法局。

在机构改革中，不仅自然资源执法队伍调整变化大，有的地方还把自然资源部门与城乡建设部门合并了。

比如，武汉市组建市自然资源和城乡建设局，作为市政府工作部门。承担国土空间等规划、自然资源管理、生态修复、城乡建设计划和项目管理、建筑市场监督管理、村镇建设等工作。市自然资源和城乡建设局划入市自然资源和规划局职责；划入市城乡建设局城乡建设计划和项目管理、建筑市场监督管理、推进城乡建设科技进步、村镇建设等职责。不再保留市自然资源和规划局。

2023年12月，广东省清远市政府发布收回乡镇街道行政执法事项清单的公告，收回57项行政执法事项，理由是“因专业技术性强、执法对象少、认定困难、由县级行政执法部门集中行使更高效等原因不宜下放”。此前，2021年1月和2023年7月，清远实施镇街综合行政执法，分两批放权共385项。

2023年7月2，广东省揭阳市政府发布公告，决定对部分专业性强、乡镇街道确实无法有效承接的，以及因相关法律法规修改、废止等原因不能下放的行政执法事项共19项，现予以收回。