1947年5月，就在夏季攻势之前，东北民主联军1纵换将，上级将万毅换下，李天佑接替。

对于此次职务调整，万毅心里是不舒服的，但从指挥方面来说，确实是一个正确的选择。李天佑不仅仅是过去1纵1师的老首长，而且擅长攻坚作战，敢打硬仗、恶仗。部队在他手中可能更能发挥作用。

至于万毅的安排，有两个选择，一个是去担任松江军区司令，或者到齐齐哈尔步兵学校当校长。从职务来说是平级调动，但是分量就千差万别。军人最高荣誉就是战死疆场，马革裹尸，更何况东北是他的家乡，更愿意为解放家乡而奋战在一线。让他到后方不是不行，但认为在前线更合适。

最终他的任职进行改动，继续在野战纵队工作，改为政委。这是东总首长对他的“迁就”。

从东北部队将领来说，能打仗，会打仗，打硬仗的比比皆是，他被派去组建1纵，从自身角度来说，还是因为自己是东北人的缘故，希望凭借这一点，在政治上也发挥作用。传递一个什么信息，国民党军军官走上革命道路也可以在队伍中担任要职，而且让东北老百姓在思想认识到，革命队伍不像国军宣传的那样。

以上是在政治方面的影响力

在职务上，他不仅仅是纵队首长，而且还是七大的候补委员。七大候补委员中，在军队的不多，几位后来被评为大将的老资格，以及个别被评为上将的老资格。

他在几个纵队首长中，政治地位是非常高的，他也有直接上中央反映的权利。像黄克诚是候补委员，在一些问题上可以直接给中央汇报，这是他的权利。

总部还是希望顾全大局，也希望他能继续在前线发挥作用，但重点是必须让李天佑担任司令，他让出来后，担任1年政委，1948年3月改为5纵司令，直到平津战役后离开作战部队。