生信文章包含哪些?用一句话来总结就是:凡是基于测序数据进行分析的文章,都是生信文章,如果按照这个观点来看的话,单细胞测序与孟德尔随机化研究,毫无疑问也是属于生信。
传统的生信,主要分为这么四步:
1️⃣针对测序数据进行差异分析,找出不同分组样本当中,差异表达的基因。
2️⃣针对差异表达的基因,进行功能聚类,将差异基因按照不同的信号通路或者相关功能进行富集分析。
3️⃣构建分子互作网络,也就是找到这些差异表达基因之间的一些内在联系。
4️⃣回归到我们研究科学问题本身,上述这些基因表达差异、信号通路或者功能的差异,以及分子之间相互联系,具体反馈到我们实际研究的科学问题上,会得到怎样的结论?
单细胞测序,其实就是针对不同细胞亚群的研究,主要用于三个方面的研究:
1️⃣图谱类研究
2️⃣用于研究的发现阶段
3️⃣验证类研究
而孟德尔随机化,用一句话来概括,就是利用自然界中,随机分配的基因型对表型的影响,进一步推断表型对疾病的影响。主要是用于推导因果关系。
👉医学生为什么要学习生信分析?
无论什么时候,生信分析都值得医学生学,因为它不只是能发文章。生信分析如同英语的功能一样,它是一门技术和手段,它可以帮你懂得如何利用大数据,如何分析自己的数据,如何利用别人的数据为自己的研究添砖加瓦?
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