学习任何一种新知识之前,我们都要找到学习的动力,只有动力足够强,在遇到困难时才不会轻易退缩。反之,就像学习生信分析遇到报错就半途而废的大有人在。
有的人为了快速发表一篇SCI,有的人为了掌握一项新技能,有的人为了更好地服务临床,有的人为了提升自己的竞争力,有的人为了晋升……
这都是别人的目标,你学习生信的理由是什么,可以留点时间给自己思考,想清楚后再开始学习入门。
⭕第一步:基础知识学哪些:
🕠生信分析是什么?
🕠测序基础流程与原理
🕠read/count/fpkm/tpm是什么?
推荐B站UP主【统计之光公开课】-王博士讲生信系列。推荐大家学主要是因为,王博士也是从0开始以小白的角度与大家一起学习,讲得非常细,超级适合入门!
🕠数学基础
学习一些线性代数、概率论、数理统计、多元统计分析的知识,这些有助于理解一些常用的基础算法。可以上MOOC学习。①线性代数-同济大学
②概率论与数理统计-北京科技大学 ③多元统计分析厦门大学
🕠编程基础
医学生平时都挺忙的,编程首选学习R。
一定要把数据结构和tidyverse包学好,以及安装各种R包也是个难点,需要多点耐心。
⭕第二步:常用数据库入门
TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库
GEO(Gene Expression Omnibus)基因表达综合数据库
⭕第三步:学分析方法
入门级别:差异分析、功能聚类、PPI网络
中级级别:单因素COX回归分析、Lasso回归分析
模仿往往是学习新技能最快捷的方法,了解完生信必备知识后,大量看生信SCI,拆解作者分析思路,也是一种快速了解生信全貌的方法。
生信SCI阅读的关键点:①别人做了什么?怎么开展的?②每个figure如何选数据的?参数是什么? ③Figure的结果如何解读?④全文的结论怎么下的?
⭕第四步:实践!实践!实践!
学习最有效的还是要参与到项目中,从0开始把这个项目落地见刊,你才能真正明白生信SCI是怎么回事!
如果你觉得自己操持一个课题很困难,不妨找个生信大佬带着你学,为你定制教学计划,一步一步指导你落地新项目,不走弯路!