如何进行线粒体形态分析统计(一)

探索哒哒猫 2024-07-18 18:20:36
不懂就问有问必答 科研 科研日常线粒体 线粒体是一种高度动态变化的细胞器,不断进行融合分裂来保持形态结构的平衡,融合分裂失衡直接影响线粒体网络形态和细胞功能。线粒体网络指线粒体的分支、网状结构以及线粒体压力下产生的点状或者肿胀线粒体等。 [向右R][向右R][向右R]线粒体形态分析有助于更好的理解线粒体在不同应激压力下的状态,可以使用基于免费开源软件ImageJ开发的分析线粒体网络的宏—MiNA,该工具包含一些可选的预处理步骤将原始线粒体图像转换为二进制图像用于计算线粒体网络参数。MiNA工具不仅可以用于评估线粒体网络的形态学特征,可区分单独线粒体结构和网络结构。除识别网络结构外NiNA还可对各个网络结构内部分支的程度进行评估,从而识别线粒体过度融合的细胞,即具有非常高度分支结果的线粒体网络。 [向右R][向右R][向右R]MiNA可免费获取,下载后安装MiNA宏,打开FIJI,点击Plugins,Macros,Install,选择MiNA-master中src下的MiNA.ijm文件,在Plugins,Macros即可看见已经安装成功的宏。安装后可以直接进行分析,也可以多步骤来分析,具体分析如图所示[笑哭R]。 [向右R][向右R][向右R]分析后更重要的是进行统计。一般来说统计可以分为三种方法: [拔草R][拔草R]当线粒体形态为常规形态时,比如说管网状,点状和中间态,没有明显的肿胀和膨胀球体以及大部分甜甜圈等形态时,这时候可以按上面做平均长度分析,分析后可以以散点图来表示,或者是根据分析的平均长度来做长度范围分类,根据分类来做比例分析,我们也知道即便是生理状态下的细胞内线粒体可能也存在不同形态,应激处理后可能造成某种比例显著增多而不是说全变成了一种形态。 [拔草R][拔草R]在进行平均长度或者比例统计之外,还可以根据平均长度范围来把线粒体分为elongated,fragmented或者intermediated等类型,在长度分析之余再有一个形态分析的统计图更为完备。 [拔草R][拔草R]当细胞内的线粒体为非常规意义的线粒体形态时,比如说肿胀,膨胀球体以及甜甜圈等,这时候可以用一些形象的专有名词来进行描述和分类统计。在做这类形态分析时,可以以面积,圆度等来进行统计,具体问题具体分析。我们新出的一篇用Mitochondrial analyzer插件分析相对MiNA插件可以适用更多的线粒体类型。

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评论列表
  • 2024-07-19 18:04

    牛 刚好需要

  • 2024-07-19 17:15

    可以自动化

  • Zike 1
    2024-07-19 17:37

    您好 想请问一下 这个可以分析线粒体和内质网的距离和接触长度的分析吗?