🙋♀️刚学习生信的同学,可能会经常听到counts, FPKM,TPM这几个概念,但这几个具体有什么区别?应该如何使用,很多人还是搞不清楚,这几个概念其实不复杂。
最重要的是你知道counts, FPKM,TPM在什么情况下用就可以了!!
✅counts
用途:用相关R包做差异分析时,当作原始数据输入
备注:原始值
✅FPKM
用途:组内比较,早些年也用作组间比较,但不够准确
备注:考虑了测序深度与基因长度,仅做了标准化,未做归一化处理
✅TPM
用途:组内比较+组间比较
备注:考虑了测序深度与基因长度,做了标准化和归一化处理
以上就是counts, FPKM,TPM的用法啦,你听懂了吗?如果你想快速学会生信分析,自己学太难的话,不妨找统计之光的老师指导你,生信老鸟定制化教学,一对一直播授课带你走完全程,不再担心走弯路!