针对朝鲜民族起源于中原的说法，朝鲜认为所谓的萁子东移说是站不住脚的。朝鲜人民的伟大领袖金日成主席提出，在伟大领导者金正日将军亲自组织发掘的情况下，1993年2月，果真在平壤附近发掘了檀君遗骨和遗物，并确证它为距今(1993年)5011年前的。朝鲜人民由此找到了民族的原始祖，明确了朝鲜是具有5000年悠久历史的国家，朝鲜民族是以檀君为原始祖的单一民族。 1993年，朝鲜官方的发掘报告称，檀君陵内的文物曾遭到日本考古学家的大肆盗掘和掠夺，壁画也遭到严重破坏。这次发掘出土了两副人骨（称男性遗骸身长超过170厘米）、带有金铜王冠、环带碎片各一片、金铜链式腰带等文物。 同年，朝鲜学者表示确认他们是檀君夫妇的遗骨”。该陵墓的构造与高句丽时期的坟墓构造相似，朝鲜考古学家认为这是高句丽时代进行修复的结果。朝鲜学者表示，檀君的遗骨之所以没有被腐蚀而保存至今，是因为它埋在了石灰岩地带。 朝鲜将檀君陵认定为“民族始祖王之墓”以及檀君陵内蕴含着金日成与金正日的革命事迹，并以檀君陵为理据宣称朝鮮民族拥有上下五千年源远流长的灿烂文化。由于朝鲜民主主义人民共和国禁止外界对檀君陵进行考古研究，其真实性一直存在争论。 首尔大学教授李鲜指出檀君陵的挖掘存在以下问题与疑点： “ 一，即使出土的遗骨真的是5000年以前的，也无法直接证明它就属于檀君本人。 二，关于檀君陵的最古老的历史文献也仅是16世纪编纂的完成的《新增东国舆地胜览》，但包括它在内的所有历史文献都以“根据传统，这里是檀君陵”的形式引用。李鲜馥表示，不可能有古墓的确切位置流传了5000多年。 三，电子常磁性共鸣年代测定法在当时仍处于早期发展阶段，由于理论和技术上的限制，只适用于旧石器时代的文物，即10万年前的文物，因此不能指望它能为5000年前的分析提供准确的年代。 四，如果发掘出的王冠是真的，则意味着人类在公元前3000年掌握了镀层技术，这将改变整个人类历史。” 日本学者对檀君陵的真实性普遍持怀疑态度。日本历史学家冈田英弘表示，是主体思想让朝鲜当局试图将民族历史与中国文明撇清关系而制造出的檀君墓。