在WB实验中,获得一张“漂亮”的实验图不仅是科学数据的要求,也能够增强结果展示的效果。以下是一些关键的步骤和技巧:
[一R]优化样品制备
蛋白提取:确保样品蛋白提取充分,减少降解,避免杂质干扰。
蛋白定量:准确测定蛋白浓度,确保每个样品的上样量一致,避免条带浓度差异过大。
样品缓冲液:使用新鲜的SDS-PAGE样品缓冲液,避免样品变质导致条带模糊。
[二R]电泳过程控制
适合的凝胶浓度:根据蛋白分子量选择适当的分离胶浓度。
样品加样:尽量均匀地加样,避免蛋白泄漏,影响条带形状。
跑胶时间控制:预染蛋白Marker的标准线条带作为跑胶的参考,确保蛋白迁移到理想的分辨位置,防止条带偏斜或扩散。
[三R]转膜条件优化
选择合适的转膜参数:根据蛋白分子量选择湿转或半干转。大分子量蛋白一般适合湿转,使用低电压和较长时间,而小分子量蛋白适合半干转。
选择膜材:PVDF膜对于高分子量蛋白吸附效果较好,通常适用于较宽范围的分子量检测。
转膜质量检测:在转膜后用Ponceau S染色检测膜上蛋白分布,确保转膜均匀。
[四R]抗体的选择和稀释
使用高质量抗体:确保抗体特异性和敏感度。
优化抗体稀释度:进行梯度稀释实验,找到最佳的一抗和二抗稀释比例,避免背景干扰。
封闭时间和封闭剂:确保封闭充分且时间不宜过长,可使用5%脱脂奶粉或快封试剂,避免非特异性结合。
[五R]发光试剂的选择
灵敏度选择:根据目标蛋白丰度选择发光灵敏度合适的化学发光试剂,避免高丰度蛋白过曝或低丰度蛋白信号太弱。对于低丰度蛋白,可选用超敏型发光试剂。
均匀涂布:试剂在膜上均匀涂布,避免条带不均。
[六R]曝光和成像
曝光时间控制:从短时间曝光开始,避免条带过曝。对于高灵敏度发光试剂,最好控制曝光时间,保证条带清晰锐利。
使用数字成像设备:如果条件允许,尽量使用数字成像系统(如ChemiDoc),获得更高分辨率的条带图像。
调整对比度和亮度:在ImageJ或Photoshop等软件中适当调整对比度和亮度,增强条带细节和清晰度。
[七R]背景清除和数据处理
清除背景:避免使用过多的发光试剂,背景过高时会影响条带清晰度,尽量使用特异性更好的抗体。
图像修整:确保条带整齐,裁剪时保持重要标记(如Marker)的条带可见,避免影响对比效果。
[八R]选择合适的内参抗体
根据目标蛋白的分子量和丰度,选择合适的内参抗体(如GAPDH、β-Actin等),确保内参条带不与目标蛋白条带重叠,并且在实验条件下表达稳定。