1946年1月，邱清泉带着第5军离开昆明,，于3月到达浦镇，负责卫戍南京外围。当时，国民党军队已经对解放区频繁发动摩擦和进攻，邱清泉在接到南京国防部的命令后，下令所部第45师由六合向天长进攻，第96师由来安向盱眙进攻。 第45师在马家集的师部发生了霍乱，一夜之间死亡几十人，但邱清泉并不管这些，“催动”两个师并列向北攻击，逢村必攻，逢地必打。结果，正面攻击的第45师自动“打”入解放军的包围圈，在六合马家集苦战3天3夜，始终无法突围。5月23日，第96师绕道六合马家集，以一团兵力直取天长，解放军兵力有限，便撤离了，被围困在六合马家集的第45师因此而解围。战后，邱清泉大肆吹嘘，但是南京国防部则不以为然，战后总结称：“本战斗费时费力，结果仅将共军赶入第8绥区战场，此非战之罪也，实归咎徐州绥署之大军统率太糟。” 6月初，第5军经过十几天整顿后，从江苏宿县窜到山东单县、城武，与其他国军长侵入山东解放军，邱清泉还让军政治部带了十几个县长，“打”下一个县“放”一个，就在邱清泉志得意满的时候，却引发了窝里斗。 6月底，胡琏的整编第11师（原第十八军）临时划归第5军邱清泉指挥。整编11师是“土木系”骨干部队，归第5军指挥后，其中有一团在张凤集、张表集之间布防。有一天晚上，为了军事上的部署，邱清泉命令这个团长向右翼一个空缺去靠近。胡琏则命令团长准备右移，理由是他的部队正和解放军“胶着”。 原来，警戒心极高的胡琏认为这是“邱清泉怕自己的部队牺牲，所以要我去牺牲”，整编11师也是军级建制，胡琏对于划归邱清泉指挥，心中是很不服气的，因为他不仅让手下团长拒绝执行邱清泉的命令，反过来还要求邱清泉的第5军“向左翼靠近”。 第五军当时尚未整编，所以邱清泉和胡琏在军职是平级的，而且南京国防部也明确了，只是让邱清泉临时指挥胡琏，如此一来，这个团长不知道到底是听邱清泉的还是胡琏的，只得下令全团原地不动，结果该团被解放军歼灭大半，团长带着少部分人逃了出来。 邱清泉暴跳如雷，叫着要枪毙这个团长，这个团长喊着说：“全团灭亡，不过是你们指挥命令不统一下的牺牲品，岂能怪我！” 这个团长随后跑到老长官胡琏那里，添油加醋地告了邱清泉一状。胡链听了后大为不快，从此与邱清泉结下了梁子，胡琏和邱清泉此后，两人基本是势同水火。 在整编第11师划归第5军指挥后，就发生将领不和，并直接造成了损失一个团的严重后果，双方的不睦不解决势必影响整个战局。在城武地区负责指挥的王敬久，亲自跑到前方司令部前陈楼举行军事检讨会议，试图调解邱清泉、胡琏的关系。战地房子极简陋，第五军、整编11师的参谋政工人员都参加。 会议开始，胡琏从张表集赶来，一进门，邱清泉很客气地称呼他“伯玉兄”，胡琏也称他“雨庵兄”，双方客客气气，然后当谈到一个团被歼灭这个话题时，两人就都动怒了，开始直呼对方名字。 两人越说越气，最后甚至拍了桌子。论军职，两人不相上下，邱清泉是第五军军长，胡琏的整编11师是由第十八军改编的，第五军和第十八军都属于蒋军“五大主力”；但是，论资历，邱清泉是黄埔二期，胡琏是黄埔四期；论军衔，两人当时都是少将军衔，也都是到了1948年才实授的中将衔。所以，除了在军校的资历上有点优势外，邱清泉和胡琏在其他方面是相仿的，邱清泉向来跋扈，但是胡琏也不是省油的灯，所以两人这次是狠狠的吵了一架。 黄埔一期的王敬久，名义上指挥邱清泉、胡琏，但实际上邱、胡两人各有各的背景，最后，胡琏拂袖而去，邱清泉也气冲冲地走了，留下了一脸郁闷的王敬久。 王敬久面对其他参会人员，只得尴尬地打圆场说：“按军令指挥系统而言，当然胡师长不对，但按军事情势而言，胡师长所陈述调不动军队的理由也有可取之处，关键在于胡师长具有成见，不服邱军长的指挥，因此也不愿事先陈述理由，以获得军长谅解；加上军事会议的争吵，关系更形尖锐化，因此两个人都没有错，也都有错。” 王敬久开会本意是修复邱清泉和胡琏的关系，以便让第五军和整编11师能配合作战，但是结果适得其反，两人在会上完全决裂。王敬久生怕邱、胡两人的不和在接下来的战场上再误大事，连累自己，慌忙把情况上报南京国防部。 事后，南京国防部也“妙”得很，对这一“纠纷”既没有处置，也不问是非，只把整编第11师划归第6绥靖区区寿年指挥了事。 这次风波的背后，是国民党将领之间明争暗斗，互不配合的一个缩影，在这种状况下，其战斗力就可想而知了。