当发现员工挪用公款 5000 元时，应采取以下谨慎且合理的处理步骤。

首先，立即展开内部调查。收集相关的证据，如财务记录、资金流向、相关文件和通信记录等，以确定挪用公款的事实和具体情况。 与涉事员工进行谈话，了解其挪用公款的原因和动机。在谈话过程中，保持客观和冷静，明确告知其行为的严重性，并要求其如实交代问题。 如果员工能够主动承认错误，并愿意尽快归还挪用的款项，公司可以考虑给予其一定的改正机会，例如内部警告、降职或其他纪律处分。

然而，如果员工拒绝承认或不愿意归还款项，公司应毫不犹豫地向公安机关报案。挪用公款属于违法行为，5000 元的金额虽然不算巨大，但仍需依法处理。 在法律程序中，积极配合执法机关的调查工作，提供所掌握的证据和信息，协助查明事实真相。

同时，公司内部应借此事件进行反思和整顿，完善财务管理制度和监督机制，加强对资金使用的审批和监控，防止类似事件再次发生。 对于其他员工，也要进行相关的法律教育和职业道德培训，强调遵守法律法规和公司制度的重要性。

总之，对于员工挪用公款 5000 元的情况，要依据事实和法律，采取适当的处理措施，既要维护公司的利益，也要遵循合法合规的原则。