台湾雄风-3反舰导弹飞行速度可达2.3-2.5马赫，超音速飞行能缩短敌方防御系统的反应时间，增加拦截难度。其全程掠海弹道飞行射程150-200千米，高弹道飞行射程最大可达300千米，具备一定的远程打击能力。

雄风-3导弹配备了所谓自研的冲压发动机，弹体装备两种不同卫星导航系统替换，防止作战时导弹找不到目标。为实现超音速突防采用冲压式发动机，帮助推段加速到一定速度后才能点火启动。且为达最大射程采用顶端1.5万米高空的类高抛弹道，俯冲时才能加速到最大速度，这种飞行方式容易被提前探测和拦截。

该导弹受台湾整体作战体系限制，其雷达中继系统和GPS制导易受干扰，若数据链受打击中断，导弹难以发挥作用。2016年7月1日发生"误射"事件，导弹最后掉落澎湖海域，击中贯穿高雄精渔船翔利升号船尾，造成船长身亡，3名船员受伤。

对于台湾雄风-3反舰导弹，可利用歼-20等五代战斗机的隐身特性和超视距作战能力，以及轰-6K远程轰炸机的远程打击能力，对台湾的雄风-3反舰导弹发射阵地、舰艇等发射平台进行精确打击，在其发射前将其摧毁。

运用火箭军的东风系列弹道导弹等远程打击武器，对已知的雄风-3反舰导弹部署区域进行饱和攻击，破坏其发射设施和相关保障系统。出动电子战飞机在空中对雄风-3反舰导弹的雷达通信和制导系统进行干扰，使其无法准确获取目标信息，降低导弹的命中精度。

电子战部队也可在陆地或海上利用电子干扰设备，对敌方的重要设备进行干扰或欺骗，干扰台海地区的GPS信号，让雄风导弹不能使用GPS信号进行寻航，使导弹偏离目标。

在海上，利用舰载防空导弹红旗九臂等，对发射后的雄风-3反舰导弹进行中远距离拦截，在其飞行中段将其摧毁。