所谓权力，无非人事、财政、军事、司法。我们分别就这几个方面看看谁管理的更多。本文讨论的是清代太平天国运动前的状态，清代晚期，总督有节度使化的趋向，这里不讨论。
人事权 各地的大小官员由谁任命呢？ 清代的地方官员大部分由巡抚向皇帝推荐。总督只负责军事要地的官员，比如海疆、苗疆或沿江河之缺。
即便是吏部发下去的进士， 也要由巡抚决定具体派到那个县任职。
人事考核权总督和巡抚最重要的权力就是考核权， 很多高级的地方官，比如知府，甚至布政使由中央直接任命的， 但是他们已经服从于巡抚。 就是因为巡抚掌握着考核权。
地方官员每三年一次，由巡抚和总督写定评语送给皇帝。 皇帝不会认识地方的官员，这个考核基本上就决定了这个官员的后续是升迁还是免职。按照清朝的惯例，文官由巡抚负责，武官由总督负责。
财政大权 各省的钱粮向来由布政使办理，但是布政使是巡抚的属官。雍正皇帝也曾经专门下旨：“管理钱粮，系巡抚专责……凡各省钱粮，总督旧无兼办之责，今令田文镜、迈柱兼理者，乃因人而施，后不为例。”
清代司法历来的习惯是，死刑全部由巡抚审核，上报刑部。除非皇帝下特旨办理的案件，否则总督无权过问。著名的小白菜一案中，最后被处理的是浙江巡抚。而闽浙总督没有受到任何影响。
乾隆帝上谕中提及：“秋谳大典，由各省巡抚分别情实、缓决，核准具题。”
军事权力各省的绿营兵惯例由总督负责管理。但是军事调动是要有兵部的行文。在和平时期，总督不可能随意调兵。
由上面可以看到，地方的日常事务基本由巡抚负责。总督的级别高于巡抚，但是巡抚不是他的下属。总督基本上处于一种地位高，却管不了事情的状态。清廷设计这种制度的目的，就是用总督监督巡抚。
太平天国运动后，大部分中国进入战乱状态。各地总督以备战为名，夺取了财政大权和人事任命权，成为了真正的封疆大吏。
