【AbMole科研快报】单分子测序全面分析乳腺癌基因组的结构变异

AbMole生物 2020-12-07 16:34:06

AbMole精研抑制剂十年,最新的科研动态不断与您分享。本期与您分享的是:单分子测序全面分析乳腺癌基因组的结构变异

改进对癌症结构变异(SVs)的识别,可以带来更有针对性和更有效的治疗选择,并增进我们对疾病及其进展的基本了解。本项研究中,使用Illumina/10x Genomics、Pacific Biosciences (PacBio)和Oxford Nanopore Technologies (ONT)测序,对两名乳腺癌患者的SKBR3乳腺癌细胞系、患者源性肿瘤和正常组织体进行了全基因组测序。然后,研究人员使推断SVs和大规模等位基因特异性拷贝数的变异(CNVs)。研究结果表明,长读测序技术可以大大提高SV检测的准确性和敏感性,两种长读技术都能检测到90%到95%的变异。研究人员还报告了即使在相对低的覆盖率(25x-30x下),长时间读取技术表现出了高精度。此外,研究者将SV和CNV数据整合到统一的核型图结构中,以更准确地表达突变的癌症基因组。在已知的癌症相关基因中,发现了数百个只能通过长时间测序才能检测到的变异。这些发现强调了需要对癌症基因组进行长时间的测序,以精确分析其遗传的不稳定性。

Y-27632 (Abmole, M1817,纯度 99.66%)是一种选择性的ROCK1(p160ROCK)抑制剂,Ki为140 nM,比对其他激酶包括PKC,cAMP依赖性蛋白激酶,MLCK和PAK的作用强200多倍。

作者在研究过程中,建立了患者源性肿瘤和正常的类器官。在类器官培养基中,采用了Y-27632这一重要成分。

Y-27632 2HCl是一种选择性的ROCK1(p160ROCK)抑制剂,Ki为140 nM,比对其他激酶包括PKC,cAMP依赖性蛋白激酶, MLCK和PAK的作用强200多倍。Y-27632也同等有效抑制ROCK-II。Y-27632作用于PKC, cAMP依赖的蛋白激酶和 肌球蛋白轻链激酶(MLCK)几乎没有活性,Ki分别为26 μM, 25 μM, 和 > 250 μM。Y-27632通过选择性抑制Ca2+敏感化,而抑制多种兴奋剂而不是KCl,包括Phenylephrine, Histamine, Acetylcholine, Serotonin, Endothelin,和Thromboxane诱导的平滑肌收缩,IC50为0.3-1 μM

鸣谢:Aganezov S , Goodwin S , Sherman R M , et al. Comprehensive analysis of structural variants in breast cancer genomes using single-molecule sequencing[J]. Genome Research, 2020, 30(9)

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