2007年，南京博物院联合扬子晚报，面向市民和专家，从博物院收藏的近百件精品文物中，评选出了18件镇院之宝，还专门举行过镇院之宝的特展，这些宝物分别是——

金兽：迄今我国出土文物中最大最重的金器，金属铸和锤击工艺的完美结合。

错金银重络铜壶：挟战国群雄争霸之风云，集中国古代范铸工艺之大成的青铜重器。

广陵王玺金印：全国考古发现唯一一枚汉朝刘姓王鑫印，历史和艺术价值极高。

金蝉玉叶：构思巧妙、制作精美、妙趣横生的闺房至宝。

银缕玉衣：第一件经考古发掘、科学复原且品相完好的汉代银缕玉衣。

透雕人兽鸟玉饰件：出土时代最早的人鸟兽图案透雕精品，良渚先民通天神、显权威的神秘象征物。

人面兽面组合纹玉琮：良渚文化琢玉工艺精妙绝伦的代表作，良渚人最富特色的原始宗教信仰标志物。

错银铜牛灯：最早的环保灯，烟灰通入牛身的水中，环保意识和设计领先西方1000多年。

釉里红岁寒三友梅瓶：全国现存唯一一只保存完好的带盖明洪武釉里红梅瓶。

鎏金镶嵌兽形铜盒砚：构思奇特，工艺精湛，代表了汉代制砚工艺的最高成就。

竹林七贤砖画：考古发现最早且完好的大型人物画像砖实物，20世纪中国百项考古大发现之一。

青瓷神兽尊：意态奇异、形神俱佳的西晋青瓷工艺杰作，我国最早有铭款的瓷器之一。

金观音菩萨立像：由乾隆督造，各族艺匠合力制作，代表了清代宫廷造像工艺最高水平。

鎏金喇嘛塔一组：明代佛教工艺绝品，国内出土唯一一件“迷你型”鎏金喇嘛塔。

坤舆万国全图：现在最早的据刻本摹绘的世界地图，开创了中国绘制世界地图的模式。

青花寿山福海纹瓷炉：明代宣德御窑瓷器的巅峰之作。

徐渭《杂花图卷》：中国古代写意花鸟画集大成者的精绝之作。

沈寿绣品《耶稣像》：近代刺绣大师沈寿“仿真绣”代表作品，在刺绣艺术史上有划时代意义。