2010年5月，斯万特·帕博领导的研究团队在《科学》杂志上首次发表了尼安德特人基因组草图。这些基因组DNA从属于不同尼安德特人的三块小骨头提取，而这些骨头来自克罗地亚北部的温迪加洞穴。
斯万特·帕博教授，22年的诺贝尔生理和医学奖得主
令人震惊的是，科学家发现在现代欧洲和亚洲人类基因组中竟然含有1%-4%的尼安德特人特有的基因组信息，而非洲原住民则没有，表明现代人走出非洲后与尼安德特人有过混血。
人类进化之路，我们的表亲尼安德特人和丹尼索瓦人都被灭绝了
从这个角度说，上一次冰期的末期我们的老祖先从非洲出来，基本上把欧亚大陆上的其他近亲全部干灭绝了。只是部分尼安德特人的基因传承了下来。当然现在也有一些人从样貌上看有尼安德特人的影子。
俄罗斯拳击手瓦鲁耶夫长相非常有尼安德特人特点
疯狂原始人的人物原型参考尼安德特人的宽大脑干和粗壮身材。
疯狂原始人动画中的人物
帕博教授的主要贡献倒不是发现了尼安德特人和我们曾经的交集。主要是对基因检测技术的贡献。很久以来从古代人类遗骸中提取DNA并非易事。人体的遗传物质容易受到环境微生物酶、酸、碱、紫外光影响而发生降解。
为了解决这个问题，斯万特·帕博和同事设计了专门的超净室，制定了超净室的工作规则，最大限度地减少了污染，并强调其他实验室独立再现结果的必要性。如今超净室已经成为世界上大多数DNA研究实验室的标准配置。
得益于实验手段的进步，这十几年以来，通过DNA溯源人类历史变成了一个非常有意思的分支学科。
一条祖传的Y染色体人类有46条染色体，其中决定性别的是X、Y染色体。Y染色体比较特殊因为只传男不传女，所以通过Y染色体变异可以追寻人类的迁徙路径和家族历史。
中学的时候我们就学过，DNA序列都是由A、C、G、T四个碱基组成的。一般遗传时DNA复制的序列应该是一致的，但是也会有复制出错的时候（大部分没有影响）。
如果Y染色体某个单个位点的碱基会被以上任意其他一种碱基替换，即构成一个突变。这个突变就会被男性子孙一直遗传下去。
DNA序列
这个突变也叫Y-SNP突变。也就是说从男性始祖开始，这条Y染色体没有任何突变。但是他的某个子孙的Y染色体出了一个突变，那这个子孙的所有男性都会带上这个突变点。当然这个子孙的某一代子孙也会带一个突变。
如果把男性始祖当成树干，这一个突变相当于分叉的树枝。
遗传时某个碱基复制错了
（SNP是单核苷酸多态性的外文简称，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，大部分是无害也无益的。）
如此一来，现在的基因科学就像从树枝上找树根一样可以一点一点回溯现在男性的祖先。只要把这个男性的Y染色体所有突变都捋一遍基本能定位他是哪一个祖先一路传下来的。
我大致描述一下传递规则：
祖1：AAABBBCCCDDD
儿1：AAAB00CCCDDD，那这个儿1的子孙都会带“B00”这个变异标记，他的子孙Y染色体就是这样排列：
孙1：AAAB00CCCDDDEEE
孙2：AAAB00CCCD11EEE，这个孙2的子孙又带有D11这个变异点，他的后代就带有B00，D112个标记。
儿2：A22BBBCCCDDD，这个儿子在“A22”这里变异了，他的子孙带有“A22”这个标记。后人做检测就能分析出他的子孙共同祖先是“祖1”，但是和“儿1”没有关系。
对于父系祖源的研究主要依据于Y-SNP突变，现在很多文章里面写的汉族Y染色体的基因标记是O2、O3，欧洲人的基因标记是R1b也是这个道理。
所以现在的基因寻祖找到了很多有意思的信息。
匈奴汉也是汉两汉400年的天下让刘姓人口大爆发，直到今天也是汉族的大姓。高祖刘邦的的男性后代在全国估计有1500万人，由于两汉的藩王被分封到全国各地。所以各地的刘姓后人“浓度”都很高。目前根据溯源，刘邦Y染色体突变点是O2-F155，发生突变的时间是2290年前。
携带刘邦基因的人群分布
特别在湖南地区刘姓人口中1/7可能是“汉室宗亲”。
不过陕北的刘姓大族里面Y染色体突变大部分是C-Y10420 。C为东胡—肃慎系民族的父系基因。也就是说这一支刘家人可能是草原民族南迁来的。
汉高祖基因突变点O-F155和他的下游支系
这个刘姓支系的共同祖先在1800年前，比刘邦当皇帝晚了400年。结合史料我们找到了崛起于两晋时期的居住在山西、陕西北部的匈奴人建立的汉赵政权。
当时居住在山西北面的匈奴部落首领刘渊自称是汉代和亲公主和匈奴王的后代，具有刘家天子血统。现在基因检测已经表明了刘渊的血统和刘邦很可能八杆子打不着。
但是刘渊趁着西晋八王之乱中央军队被打光的局面，举起了兴复汉室的大旗，带头祭祀历代汉朝皇帝直到蜀汉后主刘禅。最后率兵攻灭了西晋首都俘虏了晋怀帝，成了两晋南北朝时第一支称帝割据的草原民族政权。
刘渊：我也是“汉室宗亲”
陕北的这些刘家后人很大可能是刘渊政权的匈奴人后裔。刘渊这支匈奴人是霍去病收取河西走廊时投降并内迁匈奴休屠部落。霍去病怎么也想不到3百多年后还得靠这批匈奴降将恢复汉朝的祭祀。
福建大部分是汉代移民后裔，而不是古越人后裔另外一个有意思的基因检测结果是就是全国各省的的汉族标记测定，南方的福建省父系基因O2占比居然排在很前面。
以往的数据可以看出中国人的主要父系单倍群是O2、O1和C、N、Q等，其中O2为羌族、华夏的基因、O1为南方汉族基因，也就是百越民族的基因，C为东胡—肃慎系民族的父系基因。
其他几个南方省份O1和O2的分布都差的不多，O2占比稍微领先。而福建省O2独占鳌头。从公布的结果来看，福建的O2比例达到了60%远远超过O1、C、N等标记。
西汉是广泛分布于南方的越人
回到2100年前，汉武帝建元三年（前138年）到前111年。对南部的越人（今天福建一带）汉武帝多次发动大军进攻。但是闽越地区降而复叛搞的汉武帝非常头疼，最后汉武帝认为“东越狭多阻，闽越悍，数反复，终为后世患”。干脆搞移民搬迁算了，于是将闽越之人全部迁徙到了江淮。
兵家不争之地，福建省
福建的土著居民几乎被迁出，而后来迁入的大多数河北关中的居民。而由于福建的地势又实在不适合外敌大规模入侵。这一批移民后的两千年，包括近代日本人侵略，除了沿海的几个据点，内陆都很少被入侵。
福建地区七山二水一分田的地势，让历次南迁的政权也是颇为无奈，历史上除了黄巢即使中原大乱好像也没有军队在这里停很久。所以福建的O2基因比例非常之高，而且大部分是汉代移民的后裔。
福建包括福建移民较多的台湾地区出了几个很有地方特色的大姓。比如林姓，林姓名人有林徽因、林丹、林志炫、林志玲等等。林姓经过基因测序是O-Y19688(O2-F8),典型北汉南迁。
从这里也能看得出中国的历史记载确实严谨可靠，可以通过多方面证明汉武帝时的那次大迁徙确实造就了福建今天独有的血统、文化和语言。
汉族“血统”最纯的少数民族云南地区生活着许多少数民族，如独龙族、怒族、纳西族，这些民族由于长期生活在封闭的环境中，因而基因还保留得十分纯正。人类遗传学研究者对独龙族的DNA进行检测发现，他们Y染色体O3—m122出现比例100%，而O3—m122（现在归为O2）恰恰是汉族的标志性基因。
独龙族同胞
换句话说我们的祖先在曾经在云贵高原上待了很长时间，到底是当时因为气候原因还是因为平原地区被其他族群占领了不得而知。只是后来我们的先人下山了，并占据了从辽河到长江的广大区域。云贵高原还留下了部分人，如今成了怒族、纳西族。
除了这些信息，基因标记还发现了不少有意思的事，比如刘备刘皇叔的祖先中山靖王很可能不是汉景帝的血亲，这些有兴趣的读者可以自己搜索资料。
