“八旗汉军”，就是大清国八旗制度内，用汉人或汉化了的女真人为将，统领汉旗兵的部分。大清（后金）国内汉将 领汉兵的军队，从八旗制一开始就存在。八旗最初编成时的 400多个牛录中，就有16个汉将领汉兵的牛录，即由汉人任 牛录厄真，率领由汉人编成的牛录军民。这些人都是原来就 居住在后金(女真）国内的汉族人。编成八旗后，他们基本 上都变成了“陈满洲”。
后金天命三年(1618年)，努尔哈赤围攻抚顺时，明游击 将军李永芳投降。努尔哈赤厚待之，以女孙妻李永芳，称为 “抚顺额驸”，升为三等副将，即令其管领抚顺投降的汉族军 民。但彼时他们没编入八旗牛录，也不称“汉军旗”。
天命六 年（1621年）后金攻沈阳、辽阳等地时，李永芳均率所部汉 军从征，有功，晋升三等总兵官。又有汉化了的女真人佟养 性，原居辽东佟佳地方，遂以居地为汉姓，迁居抚顺为商贩， 暗通后金，明边官捕之入狱。后逃归努尔哈赤，赐以宗女为 妻，授二等副将。时归附后金的汉人日众，遂以佟养性为总 兵官统领之。天聪初，为佟养性单编一队汉军，满语呼之为 “乌真超哈”。天聪五年（1631年）以佟养性为昂邦章京（领 4个牛录)，天聪六年七月卒。
天聪七年(1633年）早已叛明的将领孔有德、耿仲明率 其所属的官兵及眷属等2000多人投奔后金。太宗封孔有德为 恭顺王，耿仲明为怀顺王，仍领其旧部官兵，称之为“天佑 兵”。次年，明将尚可喜又率部降于后金。太宗封尚可喜为智 顺王，仍领其旧部官兵，称之为“天助兵”。以上这些汉将领 汉兵者，均无“汉军旗”的称号。
正式建立汉军旗是从天聪七年一月开始的。太宗下令，原 先分入八旗满洲中的汉人壮丁，每10丁中抽出1丁披甲入伍，共得1500人，组成了一个“汉军旗”。旗用黑色，由汉 将马光远任固山厄真。 马光远，明顺天大兴人，原任明建昌参将，天聪四年正 月永平战役中，降于后金，升为副将。天聪五年攻明大凌河， 马光远有功，故以之为此一汉军旗的固山厄真。
天聪十年四月十一日皇太极登极称帝后，于议定《令 典》中，明文规定：“汉人官民男女穿戴，俱照满州式样，男 不许穿大领大袖、戴绒帽，务要束腰；女人不许梳头、缠脚 ……该管牛录章京稽查，若有违者，本身及该管牛录(章 京）拔什库俱有罪”。从此，清帝统治下的汉人均改着满装， 女人天足。
崇德二年(1637年)七月，太宗又把一旗汉军扩展为两 翼旗汉军，以马光远为右翼旗固山厄真，以石廷柱为左翼旗 固山厄真。旗的编制均照满洲各旗办理，两翼旗均用黑色。
石廷柱原系女真人，姓瓜尔佳氏，世居苏完。其曾祖布 哈，明成化中任建州左卫指挥佥事。其祖阿尔松袭父职，其 父石翰始迁辽东，遂以石为姓。天命七年太祖攻广宁，廷柱 时为明千总，出迎。太祖赐之金印鞍马，令其抚慰城中士庶， 廷柱遂以城降，授三等轻车都尉世职，命其管领降众。旋以 随上征巴林有功，晋三等男爵。天聪七年以积功晋三等子，后 以罪解任，至是起复为左翼固山厄真。 崇德四年(1639年)六月，太宗又将两翼汉军旗扩展为 四旗汉军。每旗辖18个牛录，下设梅鹿章京2员、甲喇章京 4员(即每旗分4甲喇)，每甲喇辖4或5个牛录。
马光远为汉军正黄旗固山厄真。马光辉、张大猷为梅鹿 章京，用蓝旗镶黄边。
石廷柱为汉军正白旗固山厄真。达尔汉、金维城为梅鹿 章京，用蓝旗镶白边。
王世选为汉军正红旗固山厄真。吴守进、孟乔芳为梅鹿 章京，用蓝旗镶红边。
巴颜，为汉军正蓝旗固山厄真，李维汉、佟图赖为梅鹿 章京，用蓝旗不镶边。 每旗仍为18个牛录，每牛录兵丁百余名，四旗合计兵丁 7200余名。
崇德七年(1642年)六月，太宗又将四旗汉军扩展为八 旗汉军。旗式、编制、官兵额数均同于“满洲八旗”。总共有 兵丁24050名。此八旗的固山厄真分别是：祖泽润（镶白）、 刘之源（镶黄）、吴守进（正红）、金砺（镶红）、佟图赖（正 蓝）、石廷柱（正白）、巴颜（正黄）、李国翰（镶蓝）等。
同年八月，孔有德、耿仲明、尚可喜等奏请以所部在汉 军旗下行走。太宗允之，以孔有德部入汉军正红旗籍，耿仲 明部入汉军正黄旗籍，尚可喜部入汉军镶蓝旗籍。其后所有 汉兵多入汉军旗籍：如佟养性部、李永芒部均入汉军正蓝旗 籍。
顺治元年( 1644年）清军进关，以后陆续攻战黄河和长江流域，以至岭南、云贵地方，沿途收降官兵入旗。顺治二年（1645年）招降公、伯、侯、总兵、副将、游击等官374员，编入八旗；次年又分隶降官于八旗，编为牛录。顺治十八年（1661年）将新投降官员分旗安置；次年安置孙可望余部官员均拨三旗。
康熙二十年（1681年），清朝平定“三藩”叛乱后，便把藩下佐领编入八旗汉军。“三藩”叛乱失败后，吴三桂所属佐领旧人没有编入八旗汉军，都被拨给北方驿站、官庄服役。乾隆七年（1742年）上谕：除从龙人员子孙外，汉军人丁自愿出旗为民，准入民籍。但是同时申明“包衣汉军（上三旗包衣佐领人丁）则皆系内府世仆，向无出旗为民之例，与八旗汉军，又自有别，尤不应混行援引。”
