985工程的评选共历经8年，分为2期，第一期是从1998年5月开始，按年份可细分为6批， 第一批共有2所高校入选，即北京大学、清华大学。 第二批入选的大学有7所，即中国科学技术大学、南京大学、复旦大学、上海交通大学、西安交通大学、浙江大学、哈尔滨工业大学。 第三批是北京理工大学，南开大学和天津大学。 第四批共有18所，东南大学、武汉大学、华中科技大学、吉林大学、厦门大学、山东大学、中国海洋大学、湖南大学、中南大学、大连理工大学、北京航空航天大学、重庆大学、四川大学、电子科技大学、中山大学、华南理工大学、兰州大学、西北工业大学。 第五批东北大学、同济大学、北京师范大学。 第六批是中国人民大学、中国农业大学。