隋朝大业九年（613年），时隋军征讨高丽，兵部尚书斛斯政逃到了高丽，高士廉因为是他的朋友而株连获罪，贬谪[zhé]为交趾郡的朱鸢县主簿。他是有名的孝子，由于岭南常有恶性传染病，母亲不能一起到朱鸢去，就留下妻子鲜于氏伺候奉养，补贴经费的不足。又想到妹妹没有着落，就卖掉大住宅，买了小住宅安顿妹妹住下，把剩下的钱分给母亲和妹妹，自己带上简单的行李走了。紧接着天下大乱，朝廷的消息完全断绝，交趾郡太守丘和委任他为司法书佐。 大业十四年（618年），隋炀帝遇害，而丘和却不知此事。当时钦州刺史、鸿胪卿宁长真以郁林、始安地区依附萧铣；汉阳太守冯盎以苍梧、高凉、珠崖、番禺地区依附林士弘。萧铣、林士弘分别派人招降丘和，丘和没有顺从。当时钦州的宁长真率领人众攻打交趾郡城，丘和准备出城迎接他，高士廉认为虽然宁长真人马众多，但是其孤军深入，内部关系松散外部环境紧迫，并不能坚持多久。同时城里的精干兵力足以抵御他，并不需要受其约束。丘和听从他的建议，任命高士廉为行军司马，水路陆路一齐进军，迎头打败了敌军，宁长真只是自己逃掉了，其余的兵众全部投降。
