林肯胜选总统后,南方反对共和党新政府最强硬的是南卡罗来纳州(南卡州有黑奴40.2万人,占人口总数57.2%,比白人还多)。大选一个月后,1860年12月,南卡州宣布脱离美利坚合众国,接着,阿拉巴马、佛罗里达、佐治亚、路易斯安那、密西西比、德克萨斯六个州相继脱离合众国,这七个州在1861年2月组成南方邦联(Confederate States of America,CSA)。开战后弗吉尼亚、北卡罗来纳、田纳西、阿肯色四个州也加入南方邦联,总计11个州。
南方邦联的首都最初选在阿拉巴马州的蒙哥马利,1861年6月迁至弗吉尼亚州的里士满(里奇蒙 Richmond)。
马里兰州、密苏里州、肯塔基州(林肯出生于肯塔基州)、特拉华州(Delaware)四个州虽然是蓄奴州,但并没有退出合众国,这样,北方(合众国)拥有23个州,人口的北南对比大约是二:一。南方军队的优势可能是拥有很多优秀的军队指挥官。