继承祖、父传统，尊崇道教始祖老子李聃为李皇家族的祖先，但在尊崇、扶植道教的同时，他并未禁止佛教的流传。李治为其生母建造了大慈恩寺，对当时名僧如玄奘等人礼遇有加，永徽三年（公元652年）三月，玄奘法师奏请朝廷在大慈恩寺内造塔，用以安放佛经、佛像及舍利等宝物。但是，从政治与教化的角度来看，佛教不能像儒、道那样与君主完全保持一致，如佛教徒坚持出家绝俗，割断尘缘，不拜君亲。显庆二年(公元657年)，李治下诏，禁止僧尼接受父母及尊者的礼拜，引起数百名朝臣的论辩，同年六月，李治下诏，命天下僧道致拜父母，结束了这场论辩。
